液相色谱流动相分为有机相和水相。在反向色谱中，为什么有机相最常用甲醇MeOH和乙腈MeCN呢？

一、溶解性

多数情况下，样品需要用到流动相来溶解和稀释，否则样品走着走着析出了，既影响检测结果，也堵塞仪器，要花额外时间维护。
按“溶剂效应”来说，等度洗脱时，最佳的流动相组成是与样品溶液的溶剂一致，
样品溶液的溶剂强度与流动相溶剂强度时相差较大时，可能会造成的峰展宽、峰分叉、峰拖尾等现象。

二、腐蚀性
流动相溶剂不应该对液相系统有腐蚀性。
液相系统中，与流动相接触的管路多采用高规格的316不锈钢，这种管路具有很强的抗腐蚀性。但仍有一些溶剂对于不锈钢有很强的腐蚀性，例如氯仿，含有过氧化物的色谱级醚等。
PEEK材质也有很好的化学惰性，但若长期使用二甲基亚砜DMSO、二氯甲烷DCM及四氢呋喃THF等，容易变脆和破裂。

三、吸光度干扰
当液相与紫外检测器搭配时，需要流动相在检测波长下没有紫外吸收，避免对我们要检测的样品定量定性产生干扰。
在<220nm的低紫外波长区段，短截止波长的溶剂就有基线和定量结果上的优势，比如190nm截止波长的乙腈，205nm的甲醇、异丙醇和乙醇。

四、粘度/压力
流动相溶剂应该是低粘度的。
相同流速条件下，流动相粘度越低，系统背压越低，就也适合于快速高效的液相分析。

五、安全性
从操作人员健康角度来讲，溶剂的毒性越低越好
从实验室的安全角度来讲，溶剂应该是不易燃的
甲醇和乙腈都是毒性相对较低且不易燃的溶剂，但是乙腈可以透皮吸收，所以毒性更大一些。

综上所述，甲醇和乙腈相比其他溶剂，具有样品溶解性好、管路腐蚀性弱、紫外检测干扰小、粘度低、安全性较高的优势。
甲醇与乙腈相比，甲醇溶解性更强、毒性更低，乙腈短波长干扰更小、粘度更低。